Nowością jest fakt, że  będą one łączyły fundusze strukturalne z funduszami różnych  instytucji finansowych jak Europejski Bank Odbudowy i Rozwoju, Europejski Fundusz Inwestycyjny, Bank Rozwoju Rady Europy, Europejski Bank Inwestycyjny, Bank Światowy.

Nowe instrumenty wsparcia:
 
JASPERS -  ma służyć  fachową wiedzą  krajom przygotowującym projekty w ramach Funduszu Spójności; działanie to polega na współpracy pomiędzy EBI, EBOiR i Komisją Europejską. Na dofinansowanie w ramach tego  instrumentu mogą liczyć m.in. projekty związane z przygotowaniem dokumentacji do dużych projektów infrastrukturalnych. Dla projektów z dziedziny transportu minimalna wartość inwestycji to 50 mln euro, a z dziedziny ochrony środowiska próg określono na 25 mln euro. Funduszem  będzie zarządzał zespół specjalistów liczący około 40-50 osób z siedzibą w Luksemburgu. Ma on funkcjonować od stycznia 2006 r. Przewidywane jest również otwarcie punktów regionalnych programu.

JESSICA- w ramach tego działania przewidziane jest udzielanie korzystnych kredytów na budownictwo mieszkaniowe. Jessica instrumentu ma służyć ujednoliceniu podejścia w finansowaniu budownictwa społecznego i rewitalizacji miast, tworzeniu tzw. suistanable communities w okresie programowania 2007-2013 poprzez wzmocnienie współpracy między EBI, Bankiem Rozwoju Rady Europy i Komisją Europejską. Kluczowymi etapami współpracy będą: Narodowe Strategie Rozwoju oraz nowe Programy Operacyjne na 2007-2013 przygotowane przez Państwa Członkowskie.

JEREMIE - to wsparcie Komisji Europejskiej i Europejskiego Funduszu Inwestycyjnego na rzecz poprawy dostępu do źródeł finansowania dla mikroprzedsiębiorstw, a także małych i średnich przedsiębiorstw. Zadaniem JEREMIE jest stworzenie platformy gdzie będą udostępnione różne formy pomocy dla MŚP i mikroprzedsiębiorstw, a także określenie najlepszych mechanizmów kredytowania.